O BIOBANKU

NASZE WARTOŚCI

Odpowiedzialność i zaufanie społeczne

W naszej codziennej pracy dokładamy wszelkich starań, aby działalność Pracowni Biobank UŁ cieszyła się jak najwyższym zaufaniem społecznym. Będąc dysponentem materiału biologicznego i danych wrażliwych dbamy o ich bezpieczeństwo, jednocześnie wykorzystując je w badaniach, które przyczyniają się do rozwoju nauki i medycyny.

Misja

Misją Pracowni Biobank jest szerzenie idei biobankowania w świadomości społeczeństwa. Jako jeden z członków Konsorcjum BBMRI.pl współtworzy Polską Sieć Biobanków, której celem jest zrzeszenie jednostek zajmujących się gromadzeniem materiału biologicznego i wdrożeniem europejskich i krajowych standardów pracy.

Pracownia Biobank przyczynia się do rozwoju wiedzy poprzez prowadzenie działalności naukowej, obejmującej zarówno badania podstawowe jak i stosowane. Nastawiona jest na współpracę z podmiotami naukowymi na arenie krajowej i międzynarodowej. Poprzez realizację wielu projektów naukowo-badawczych, Pracownia Biobank umożliwia rozwój nauki w zakresie genetyki, biologii molekularnej oraz bioinformatyki.

Pracownia Biobank dąży do najwyższych standardów jakości badań naukowych i oferowanych usług. Pozyskuje klientów z sektora prywatnego jak i publicznego stosując niestandardowe i nowoczesne rozwiązania, stając naprzeciw niecodziennym wyzwaniom.

INFRASTRUKTURA

INFRASTRUKTURA

Pracownia Biobank mieści się w odrębnym i nowoczesnym budynku spełniającym wszystkie niezbędne standardy bezpiecznego przechowywania danych i próbek, co umożliwia także prowadzenie badań naukowych na najwyższym poziomie. Poszczególne strefy pomieszczeń z autoryzowanym dostępem pozwalają na odseparowanie poszczególnych etapów przyjęcia, przechowywania i preparatyki materiału biologicznego, z rozdzieleniem etapów pracy laboratoryjnej w warunkach pre-PCR i post-PCR.

LABORATORIA

Pracownia Biobank korzysta z najnowocześniejszych obecnie narzędzi w badaniach genetycznych, posiadając w tym celu kompletną i niezbędną aparaturę. Specjalizujemy się zwłaszcza w biobankowaniu próbek materiału biologicznego, a także wykonywaniu eksperymentów z wykorzystaniem mikromacierzy firmy Illumina do genotypowania i oceny stopnia metylacji oraz przygotowania różnych rodzajów bibliotek do sekwencjonowania następnej generacji (NGS) na platformach Illumina.Aparatura, którą posiadamy, obejmuje:

Sekwenator NovaSeq 6000 (Illumina)

Sekwenator NextSeq 500 (Illumina)

Sekwenator MiSeq (Illumina)

Skaner mikromacierzy iScan (Illumina)

Stacja pipetująca Tecan Freedom EVO 150 do automatyzacji procesu przygotowania mikromacierzy Illumina

Aparat Agilent Bioanalyzer 2100 do elektroforezy kapilarnej

Aparaty MinION (Oxford Nanopore Techonologies) do sekwencjonowania metodą nanoporów

Linia robotyczna do przygotowywania rozcieńczeń i oznaczania stężenia kwasów nukleinowych na bazie stacji pipetującej Janus (Perkin Elmer)

Termocyklery wraz głowicami optycznymi do Real Time PCR (BioRad)

Aparat do HRM model Light Scanner (IdahoTechnologies)

Aparaty do pomiaru stężenia kwasów nukleinowych metodą fluorymetryczną Qubit 4 (Life Techonologies)

Komory laminarne II klasy bezpieczeństwa

System do obrazowania żeli (Bio-Rad)

Wytrząsarki

Piecyki hybrydyzacyjne

Termobloki

Mikrowirówki i wirówki laboratoryjne z chłodzeniem

Termomiksery

Zestawy do elektroforezy białek/kwasów nukleinowych

Autoklaw oraz suszarkę/sterylizator

Drobny sprzęt laboratoryjny (łaźnie wodne, vortexy, pipety, wirówki do mikropłytek, dejonizator wody, mieszadła magnetyczne, wagi analityczną oraz precyzyjną, dygestoria)

INFRASTRUKTURA IT

Infrastruktura Informatyczna Biobanku Łódź, składa się z dwóch klastrów witalizacyjnych, utworzonych z trzech serwerów każdy. Maszyny o jednorodnej konfiguracji tworzą każdy z klastrów

1) 512 RAM, 2 x CPU: Intel(R) Xeon(R) Gold 6238R CPU @ 2.20GHz 28/56 – sumarycznie 112 Logicznych CPU)

2) RAM: 512 GB; CPU: Intel(R) Xeon(R) Gold 6238R CPU @ 2.20GHz 112 logicznych rdzeni.

Na potrzeby analiz dostępna jest również karta graficzna (GPU) wykorzystywana w celach obliczeniowych Tesla T4 oraz Serwer Dragen firmy ILLUMINA wykorzystujący technologię FGPU – znacząco przyśpieszającą obliczenia. W tym roku planowana jest rozbudowa infrastruktury obliczeniowej o klaster kart graficznych nowej generacji NVIDIA P40, składający się z 4 do 6 kart.

Uzupełnieniem infrastruktury jest przestrzeń składowania danych zbudowana z kilku macierzy i NASów o łącznej pojemności użytkowej przekraczającej 2PB co stanowi równowartość ponad 2 000 TB. Na szczególną uwagę zasługuje 36 TB macierz zbudowana tylko z dysków SSD dzięki czemu osiąga ogromną prędkość zapisu wynoszącą nawet 250 000 IOPS. W taki sposób zgromadzone/przechowywane dane podlegają polityce kopii bezpieczeństwa wynikającej z wdrożonego systemu zarządzania jakością. Procedura kopii działa w oparciu o oprogramowanie Commvault i biblioteki taśmowe. Zastosowano również redundancję geograficzną – kolokując część sprzętu w odrębnym budynku. Obie lokalizacje wyposażone są w system podtrzymywania zasilania UPS oraz agregat prądotwórczy. Ponadto serwerownia biobanku wyposażona jest w system gaszenia gazowego i dwie linie zasilania z niezależnych podstacji elektrycznych.

POMIESZCZENIA ZAMRAŻAREK

Ponadto Pracownia Biobank wyposażona jest między innymi w:

zamrażarki niskotemperaturowe -86oC

dewary z ciekłym azotem (temp. przechowywania poniżej -150oC)

zamrażarki laboratoryjne -30oC

drukarki oraz czytniki kodów (w tym skaner kodów 2D krioprobówek w statywach typu SBS)

SALE KONFERENCYJNE

Pracownia Biobank dysponuje dwoma nowocześnie wyposażonymi salami konferencyjnymi, które są dostosowane zarówno do prowadzenia zajęć dydaktycznych, szkoleń jak i spotkań biznesowych. Każda z sal wyposażona jest w klimatyzację, sprzęt nagłośnieniowy, projektor multimedialny, ekran, sieć Wi-Fi.

NAGRODY I CERTYFIKATY

Pracownia Biobank, jako znacząca jednostka na mapie Polski w zakresie biobankowania oraz usług biologii molekularnej, może pochwalić się wieloma certyfikatami i nagrodami.

Zespół Pracowni Biobank tworzą eksperci wysokiej klasy, których osiągnięcia podparte są również licznymi certyfikatami i nagrodami, w tym m.in. certyfikatem dot. Systemu Zarządzania Jakością zgodnego z wymaganiami ISO 9001:2015.

Certyfikat dot. Systemu Zarządzania Jakością zgodnego z wymaganiami ISO 9001:2015

Pliki do pobrania

Certyfikat ISO 9001 (PNG)

Certyfikat Audytora Wiodącego ISO/IEC 27001:2013